Pada tanggal 15 April 1967 Yayasan Rumah Sakit Islam Indonesia (Yayasan YARSI) mendirikan Perguruan Tinggi Kedokteran YARSI yang kelak berubah menjadi Sekolah Tinggi Kedokteran YARSI. Seiring dengan berdirinya Sekolah Tinggi Kedokteran (STK) YARSI, berdiri pula Perpustakaan STK YARSI.
Pada tahun akademik 1989/1990 Sekolah Tinggi Kedokteran YARSI berkembang menjadi Universitas YARSI dengan membuka Fakultas baru yaitu : Fakultas Ekonomi, Hukum dan Teknologi Informatika; disamping Fakultas Kedokteran. Dengan perkembangan tersebut di atas Perpustakaan STK YARSI berubah menjadi UPT Perpustakaan Universitas YARSI.